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短信显示有消息但点进去就没有的原因可能有以下几点。
1、系统缓存问题：在手机使用过程中，系统会产生缓存数据，如果这些缓存数据过多，可能会影响手机性能，导致短信显示异常，此时可以尝试清理手机缓存，重新启动手机查看问题是否解决。
2、网络问题：如果短信是在网络不稳定的情况下接收的，可能会出现延迟或丢失的情况，可以等待网络稳定后再次查看短信是否出现。
3、短信应用问题：短信应用本身可能存在缺陷或者与手机系统不兼容，导致短信显示异常，此时可以尝试更新短信应用或者重新安装短信应用来解决。
4、账户同步问题：如果使用多个设备登录同一账号，可能由于信息没有同步导致短信显示异常，可以等待一段时间让数据同步完成，或者确认其他设备是否已经删除这些短信。
如果以上方法都不能解决问题，建议联系手机制造商或运营商的客服寻求帮助，他们可能需要更深入地了解具体情况才能提供解决方案。